長(zhǎng)江河口屬三級(jí)分叉四口人海的中等潮汐河口，水域東西延綿160 km，南北橫跨90 km，水面遼闊，河勢(shì)復(fù)雜多變，如何科學(xué)地布設(shè)氯度監(jiān)測(cè)站至關(guān)重要。項(xiàng)目組吸取了傳統(tǒng)水文監(jiān)測(cè)經(jīng)驗(yàn)，在長(zhǎng)江河口現(xiàn)有水源地、規(guī)劃水源地和各分汊口的關(guān)鍵河段布設(shè)了自動(dòng)監(jiān)測(cè)站；并根據(jù)實(shí)測(cè)資料和長(zhǎng)江河口水文變化特征，在其他相關(guān)河段逐年調(diào)整自動(dòng)監(jiān)測(cè)站布設(shè)位置及個(gè)數(shù)。項(xiàng)目組幾經(jīng)探索，又結(jié)合對(duì)鹽水入侵規(guī)律的逐步掌握，不斷推敲，數(shù)易站點(diǎn)，氯度監(jiān)測(cè)站經(jīng)歷了由少到多、又由多變少的過程。自1995年建立長(zhǎng)江河口第一個(gè)監(jiān)測(cè)站——青草沙水域自動(dòng)監(jiān)測(cè)站起，長(zhǎng)江河口最多時(shí)布設(shè)了27個(gè)監(jiān)測(cè)站橋梁伸縮縫。

目前，長(zhǎng)江河口布設(shè)了15個(gè)自動(dòng)監(jiān)測(cè)站，建立了長(zhǎng)江河口氯度同步監(jiān)測(cè)系統(tǒng)，監(jiān)測(cè)站的位置及數(shù)量日趨科學(xué)合理，已能跟蹤北支鹽水倒灌的主要路徑，能充分反映鹽水倒灌的過程和全貌。

三條港監(jiān)測(cè)站位于北支中段，用于監(jiān)測(cè)該處鹽水入侵情況，較早地了解和預(yù)知北支鹽水倒灌的強(qiáng)度。青龍港監(jiān)測(cè)站位于北支上段，該處鹽度大幅升高意味著將要發(fā)生強(qiáng)的鹽水倒灌現(xiàn)象。崇頭監(jiān)測(cè)站位于崇明島西端、南北支分漢口附近，已位于南支，用于監(jiān)測(cè)剛進(jìn)入南支的北支鹽水，了解北支鹽水倒灌入南支的情況，預(yù)測(cè)對(duì)南支下游水源地的影響。太倉監(jiān)測(cè)站位于南支中上段南岸，用于監(jiān)測(cè)該處氯度及其對(duì)太倉水庫的影響。南門監(jiān)測(cè)站位于南支中段北岸，用于監(jiān)測(cè)下移鹽水的情況和預(yù)知對(duì)下游青草沙水源地的影響。陳行監(jiān)測(cè)站位于南支中段南岸陳行水庫處，用于監(jiān)測(cè)該處的氯度和指導(dǎo)水庫的運(yùn)行。吳淞口附近的3個(gè)監(jiān)測(cè)站用于監(jiān)測(cè)凌橋、吳淞等水廠的氯度和指導(dǎo)水庫的運(yùn)行。青草沙監(jiān)測(cè)站用于該水源地建設(shè)和水庫今后運(yùn)行。其他監(jiān)測(cè)站位于北港、南港、北槽和南槽，用于監(jiān)測(cè)該處的氯度和了解鹽水入侵情況。